เพปโทน (pepone) คือ โปรตีน (protein) ที่ถูกย่อยให้โมเลกุลมีขนาดเล็กลง มีกรดแอมิโน (amino acid) เป็นส่วนประกอบของอาหารเลี้ยงเชื้อ (nutrient media) เช่น nutrient agar, nuterient broth เป็นสารอาหารที่จุลินทรีย์ เช่น แบคทีเรียซึ่งต้องการกรดแอมิโนเพื่อการเจริญ

โปรตีนซึ่งใช้ในการผลิตเพปโทนมีหลายชนิด เช่น เคซีน (casein) ซึ่งเป็นโปรตีนในน้ำนม เจลาติน (gelatin) โปรตีนจากเนื้อสัตว์ ถั่วเหลือง และ เซลล์ยีสต์ (yeast) เป็นต้น 

สมบัติของเพปโทนจะขึ้นอยู่กับความบริสุทธิ์ คุณภาพของโปรตีนที่ใช้ และวิธีการย่อยโปรตีน การย่อยโปรตีนเพื่อให้ได้เพปโทน อาจใช้ กรด ด่าง หรือเอนไซม์ (enzyme) เช่น โปรติเอส (protease) แต่การย่อยด้วยกรดหรือด่าง จะทำลายวิตามินและกรดแอมิโนบางชนิดที่เป็น

บางส่วนในโปรตีน

เพปโทนที่ใช้ในอาหาร ได้แก่