โปรตีเอส หรือ โปรตีเนส เป็นกลุ่มของเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาการไฮโดรไลซ์โปรตีน โดยตัดที่พันธะเพปไทด์ เอนไซม์นี้มี
2 ชนิด คือ เอนโดโปรตีเนส จะตัดพันธะที่อยู่ภายในโมเลกุล และเอกโซโปรตีเนสจะตัดพันธะที่อยู่ด้านปลายสุด
ทำให้กรดแอมิโนหลุดออกไปครั้งละหนึ่งโมเลกุล ตัวอย่างเช่น เอนไซม์ทริพซินเป็นเอนโดโปรตีเนสที่มีความจำเพาะเจาะจง
มากกว่าเอนไซม์พาเพน (papain) เอนไซม์กลุ่มนี้อาจเรียกรวมว่า โปรตีโอไลติกเอนไซม์ (proteolytic enzymes)