เอนไซม์พอลินิวคลีโอไทเดส (polynucleotidase) เป็นเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยาการไฮโดรไลซ์กรดนิวคลีอิกหรือ
พอลินิวคลีโอไทด์ให้เป็นนิวคลีโอไทด์ และมีเอนไซม์นิวคลีโอซิเดส (nucleosidase หรือ nucleoside phosphorylase)
ที่เร่งปฏิกิริยาการไฮโดรไลซ์นิวคลีโอไซด์ ซึ่งบางชนิดจะมีความเฉพาะเจาะจงกับนิวคลีโอไซด์ที่มีไพริมิดีนเบส
(pyrimidine base) เช่น ยูริดีน ไซทิดีน และไทมิดีน หรือบางชนิดจะมีความเฉพาะเจาะจงกับพิวรีนเบส (purine base)
เช่น แอดีนีน และกัวนีน เป็นต้น