ลำไส้เล็กมีความยาวประมาณ 3 เมตร มีขนาดเส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ 2-4 เซนติเมตร ลำไส้เล็กแบ่งออกเป็น 3 ส่วน
ส่วนแรกเรียกว่า ดูโอดินัม ส่วนกลางคือเจจูนัม (jejunum) และส่วนปลายสุด เรียกว่า ไอเลียม (ileum) บริเวณใกล้ๆ กับหูรูด
ไพโลรัส (pylorus) จะมีท่อน้ำดีและท่อน้ำย่อยจากตับอ่อนเปิดออกสู่ลำไส้เล็ก เพื่อหลั่งน้ำดีและน้ำย่อย ซึ่งมีฤทธิ์เป็นด่าง
และจะช่วยปรับสภาพของไคม์จากกระเพาะอาหารที่มีค่าพีเอชเป็นกรดให้มีค่าพีเอชเป็นด่าง