Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)
เป็นการใช้ปฏิกิริยาที่เฉพาะเจาะจงของแอนติบอดี้ (antibody) และแอนติเจน (antigen) โดยใช้เอนไซม์ (enzyme) เช่น เพอร์ออกซิเดส (peroxidase) หรือ แอลคาไลน์ฟอสฟาเทส (alkaline phosphatase) เพื่อช่วยทำให้สังเกตุเห็นสีที่เกิดขึ้นเมื่อทำปฏิกิริยากับสารตั้งต้น (substrate) ซึ่งแสดงปฏิกิริยาระหว่างแอนติเจนและแอนติบอดี้ และความเข้มของสีที่เกิดขึ้นเป็นสัดส่วนกับปริมาณของแอนติเจนที่ปรากฏในตัวอย่างอาหาร โดยทั่วไปวิธี ELISA ใช้เวลาประมาณ 90 นาที แต่ยังต้องมีขั้นตอน pre-enrichment และ enrichment เช่นเดียวกับการวิเคราะห์จุลินทรีย์วิธีดั้งเดิมเพื่อเพิ่มปริมาณเซลล์ให้มากจนถึงระดับที่ตรวจนับได้อย่างน่าเชื่อถือ (ประมาณ 105 เซลล์ต่อมิลลิลิตร) ซึ่งทำให้ใช้เวลารวมทั้งสิ้นเร็วกว่าวิธีดั้งเดิมประมาณ 2 วัน นอกจากนั้นยังมีวิธีการอื่นๆ ในการวิเคราะห์เพื่อให้ได้ผลที่รวดเร็วมากยิ่งขึ้นไปอีก เช่น ระบบที่ใช้วิธีจับยึดเซลล์ของ Salmonella ไว้บนแท่งสำหรับจุ่ม (dipstick) ในอาหารเลี้ยงเชื้อชนิด pre-enrichment จากนั้นถ่ายเชื้อลงสู่อาหารที่ทำให้เซลล์เพิ่มจำนวนจนสามารถนำมาวิเคราะห์หาปริมาณด้วยวิธี ELISA ได้ ซึ่งการใช้เทคนิคอุปกรณ์ดังกล่าวทำให้ร่นระยะเวลาที่ต้องใช้ลงได้อีกประมาณ 1 วัน
วิธี ELISA นั้น นอกจากสามารถวิเคราะห์ปริมาณของจุลินทรีย์โดยตรงแล้ว ยังสามารถวิเคราะห์สารพิษที่แบคทีเรียสร้างขึ้น เช่น เอ็นเทอโรทอก
ซินจาก Staphylococcus aureus รวมทั้งสารพิษจากเชื้อรา (mycotoxins) ด้วย